5日，南方进入本轮最强降雨时段，江南、华南等地雨势猛烈，中央气象台继续发布暴雨黄色预警和强对流天气蓝色预警。
受连日强降雨影响，江西各地江河水库水位快速上涨，多个水电站和水库开闸泄洪。江西进入防汛重点阶段，自6月4日15时起，江西启动防汛Ⅳ级应急响应。截至6月4日17时，此轮强降雨已致江西11个设区市70个县（市、区，含功能区）超50万人受灾，农作物受灾面积56.2千公顷。
湖南多地累计降雨量突破今年极值，发生今年入汛以来最强降雨过程。受本次降雨过程影响，湖南四大河流中的沅江、资江干流均出现了洪水，部分支流水位上涨迅猛，多条中小河流24小时水位涨幅达3米至6米。怀化市、湘西土家族苗族自治州防汛应急响应提升至Ⅱ级，泸溪县、凤凰县、辰溪县更是把防汛应急响应提升至Ⅰ级。
广西气象局6月4日22时升级发布暴雨橙色预警，重大气象灾害（暴雨）Ⅱ级应急响应生效中。据气象部门统计，受西南暖湿气流影响，6月2日20时至4日11时，桂北部分地区有大雨到暴雨，局部大暴雨到特大暴雨，其中最大降雨为融水苗族自治县四荣乡477.5毫米。桂林、南宁、百色、玉林、贵港、北海、防城港等市局地出现8级以上大风。
南方强降雨影响区域与前期强降水区域叠加度高，多地灾害风险“冒头”。各地以“汛”为令，开展抢险救灾工作，最大限度保障人民群众生命财产安全。
江西宜丰县城管局执法大队队员刘雷执行抢险救灾任务时，发现3人被困在一栋老居民楼，其中包括一位半身不遂的老人。水流湍急，门打不开，刘雷破窗而入，背起老人，在队员和群众帮助下将其安全转移。“水涨得特别快，十分钟就没过膝盖了，多亏救援人员及时赶到。”73岁的被困老人徐菊华说。据了解，刘雷这组救援小分队三个多小时里解救受困群众20余人，疏散群众近千人。
在广西柳州市融水苗族自治县安太乡，山洪暴发，供电线路受损。南方电网广西新电力集团融水供电公司洞头供电所组织党员突击队21人开展抢险救灾工作。部分路段塌方，车辆无法通行，党员突击队就徒步前进，肩挑手扛将应急发电机等供电设备运进安太乡。据统计，从6月2日14时至5日16时，广西电网10千伏及以上线路因灾跳闸停运94条，29.57万用户受影响。南方电网广西电网公司累计投入人员1870人次、车辆685车次，开展应急值守、设备巡视和抢修复电等应急处置工作。
5日凌晨3时，湖南省平江县瓮江镇石坳村金光组74岁的陈果珍被一阵急促的敲门声惊醒，她打开门一看，原来是镇、村干部上门通知低洼地段和受地质灾害威胁地区的人员转移。半个多小时后，陈果珍房屋的后面发生了山体滑坡。她心有余悸地说：“幸亏他们负责，把我们叫了出来。”
气象部门预计，6日起，南方地区主雨带将阶段性南压，强降雨主要位于江南南部和华南等地；6日，广西东部、广东、江西南部、福建中南部、云南南部等地部分地区有大到暴雨，局地大暴雨。
气象专家提醒，南方已进入降雨集中期，未来十天华南、江南南部及西南地区东部等地降雨持续时间长、落区重叠度高，致灾风险加大，广东、广西、福建、江西及云南、四川、贵州、西藏等地需加强山洪、地质灾害、中小河流洪水和城乡积涝防御工作，并防范强对流天气不利影响。
